枯草芽孢杆菌对人畜无毒无害，不污染环境，具有显著的抗菌活性和极强的抗逆能力。生长快、营养简单，能产生耐热、抗逆的芽孢，可以制成各种剂型；与化学农药混用而不失活，而且批量生产工艺简单，成本也较低，施用方便，储存期长。在农业养殖业中具有重要的作用。
枯草芽孢杆菌有利于植物在营养和空间位点的竞争中得到优势。枯草芽孢杆菌的竞争作用主要包括营养竞争和空间位点竞争。可以在植物根际、体表或体内及土壤中快速、大量繁衍和定殖，有效地排斥、阻止和干扰植物病原微生物在植物上的定殖与侵染，从而达到抑菌和防病的效果。
枯草芽孢杆菌在生长过程中能产生多种具有抑菌、溶菌作用的物质，如枯草菌素、有机酸、抗菌蛋白等等，这些物质可以抑制病原菌的生长和繁殖，甚至破坏细菌结构，杀死病原菌。因此，枯草芽孢杆菌对于重茬病、根腐病、灰霉病等疾病防治效果很好。
枯草芽孢杆菌可以分泌活性物质，激活植物防御系统，增强作物的免疫力与抗病性，减轻或消除病原菌对植株的危害。还可促进多种植物种子、幼苗和根系的生长发育，增强了植物的抗病性， 从而间接地减少病害发生。
枯草芽孢杆菌不但能直接抑制植物病原菌，而且能通过诱发植物自身的抗病潜能从而增强植物的抗病性。如水稻纹枯病生防菌枯草芽孢杆菌，能诱导水稻叶鞘细胞抗病相关的酶（POD、PPO和SOD）活性增强，达到抗病效果。
枯草芽孢杆菌在土壤中形成益生菌环境，促进团粒结构形成，提高土壤保肥保水能力，增加土壤疏松度，促进根系生长。具体表现在，加速养料矿质化，将养分由无效态和缓效态变为有效态和速效态。同时，加速养料腐殖化，分泌植酸酶，降解土壤中大部分的植酸盐；产生生长素，刺激作物生长，提高种子的成活率和出苗率。
枯草芽孢杆菌在生产养殖中可谓是重要的一名成员！
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