在养殖生产中要大力提倡在饲料中不要添加抗生素与激素类药物，可使用微生态制剂、中草药制剂、新型抗菌药物及细胞因子制剂等，既安全、效果好、使用方便，又无药物残留、不产生耐药性，能保障动物性食品安全，这是养殖业今后的用药方向。
常用的微生态制剂有光合细菌、枯草芽孢杆菌、硝化菌等，通过它们的分解和吸收作用可降低水体中的分子态氨、硫化氢等有毒物质的浓度，同时亦可利用水体中的有机物，降低化学耗氧量和生物耗氧量，间接增加水体中的溶解氧含量，从而达到净化水质、预防疾病的目的。接下来，小编仔细分析一下微生态制剂常用菌种：
1、乳酸杆菌类（嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌、植物乳杆菌等）乳酸菌有10多个属、100多个种。乳酸菌在代谢过程中能产出大量的有机酸，溶菌酸及过氧乙酸等，具有很强的杀菌功能，抑制有害菌的繁殖，抑制有机物的腐烂分解；代谢中产生的多种氨基酸，合成维生素（VB1、VB2、VB6、VB12、VC），给动物增添营养物质，帮助食物的消化及吸收，促进宿主代谢，克服腐败过程，分解与转化有害物质，保障动物正常健康的生理状态；能刺激肠道的免疫细胞增加局部免疫抗体的数量，诱导免疫球蛋白A的分泌，提高动物机体的免疫力与抗病力。
2、芽胞杆菌类（枯草芽孢杆菌、蜡样芽胞杆菌、纳豆芽孢杆菌等）好氧的芽胞杆菌可消耗肠内的氧气，使局部氧分子浓度下降，抑制有害的大肠杆菌与沙门氏菌繁殖，其代谢中产生的细菌素与过氧化氢对有害菌也有强大的杀伤能力；抑制腐败菌生长，进而减少氨、胺有害物质的产生；代谢产物中的氨基酸，维生素B族，促生长因子及各种酶（蛋白酶，淀粉酶和脂肪酶等），给动物提供营养，帮助消化食物，大大地提高饲料的转化利用率；在反刍动物的瘤胃中，能分解纤维二糖，为动物提供营养；并提高免疫力与抗病力等。
3、肠球菌类（粪链球菌，尿链球菌、禽链球菌、鸟链球菌、乳链球菌等）能产生乙酸、甲酸、拮抗致病性大肠杆菌与沙门氏菌，维持肠道需氧菌与厌氧菌的比例，调节菌群平衡；还能产生VB1、VB2、VB6、VB12、VC等多种维生素。
4、酵母菌类（啤酒酵母菌、产朊假丝酵母菌等）目前已知的酵母菌有500多种，酵母菌与真菌、细菌等互生、共生培养，其代谢产物含有丰富的蛋白质与维生素，是动物的有效养分；还能产生促进细胞分裂的活性物质，有利于乳酸菌和放线菌的生长；提高动物机体的免疫力与抗病力；还可产生VB1、VB2、VB6、VB12、VC、氨基酸及多种酶类。酵母菌及其代谢产物，经处理后可作为动物饲料的调节剂、粗饲料的发酵剂、营养剂及治疗剂使用，可部分取代抗生素的应用。
5、双歧杆菌：目前已知双歧杆菌属中有30多个种类，其中使用最多的是：双叉双歧杆菌、长双歧杆菌、短双歧杆菌、婴儿双歧杆菌和假双歧杆菌等。
6、光合细菌类 光合细菌在代谢中能产生糖类、氨基酸类，维生素类等生物活性物质，这些物质被动物利用后，可促进动物生长发育，提高对饲料的转化利用率；提高机体的免疫力；还可净化水体、净化饲养环境，通过太阳能或紫外线做能源，利用有机物和有害气体为基质，净化水质与土质。因为光合菌能直接利用水中的有机物，氨态氮和硫化氢，通过反硝化作用除去水中的亚硝酸铵，还能分解池塘里的残饵和粪便等。光合细菌在水中繁殖释放出酵素，能抑制病原菌生长。
7、丝状真菌类 丝状真菌能产生淀粉酶、蛋白酶、纤维素分解酶等，能分解有机物，可促进饲料营养成分的转化与分解，提高动物对饲料的利用率。
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