1、要有选择地使用，增强针对性：
我们都知道市面上的微生态制剂种类很多，但功效不同，如要达到促进动物生长、提高饲料利用率的目的，可选用芽孢杆菌
2、复合制剂和固态制剂：
利用微生物制剂进行健康养殖，往往追求其改良水质、调节菌群、提高饲料利用率、促生长、抗病等多方面的作用。
3、使用微生态制剂应具有足够的浓度，且要持续使用才能起到较好的效果：
微生态制剂的作用主要是通过和其他微生物的竞争性抑制来实现的，只有当有益微生物菌在适宜的环境中形成优势菌群后，才能有效抑制有害微生物的生长繁殖，因此，一定要足并坚持长期连续使用，才能达到最佳效果。
4、不能与抗菌素等同时使用：
微生态制剂不能和抗生素、消毒剂以及具有抗菌作用的中草药等同时使用，否则，活菌会被杀死或减弱。因此在使用微生态制剂后的生长周期内，不要使用抗菌剂或消毒剂。
