微光合细菌的作用非常的强大，它可以净化鱼塘的水质，同时也可以间接的增氧和维持微生态平衡，让鱼有一个良好的生长环境，从而使鱼类生长快速，降低饲料系数，提高产量。
1、为鱼塘净化水质。许多养鱼户都反映用过光合细菌后鱼塘水色好看了。光合细菌能显著降低鱼塘水中的氨氮、硫化氢、亚硝酸盐，从而净化水质。光合细菌通过降解有机物粪便、腐败物来繁殖,并形成有益水体的营养物。
2、为鱼塘间接增氧。相关研究表明，光合细菌能使鱼塘增加20%-30%左右的溶氧。用过光合细菌的各地养殖户都反映用过后鱼不易浮头，省钱又增产。光合细菌又被称为“肥水菌”，通过将氨氮、亚硝酸盐转化为“肥”——硝酸盐，稳定水色，藻相好，溶氧就自然充足；同时其通过分解腐败有机物，减少了池塘晚上耗氧因子。所以，光合细菌自己虽然不直接产生氧气，但它能间接产生氧气和减少耗氧因子。
3、为鱼塘水体维持微生态平衡，预防疾病。鱼塘水体中既有有益微生物，又有有害微生物；当有害微生物群体占优势时，则易导致鱼发病。光合细菌可以和致病菌进行抗衡，夺取它的营养和空间，让病原微生物无法大量繁殖，从而不易形成致病的环境条件。
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